Q.一つのサーバに開発と本番アプリケーションを立ち上げたい

Wagbyでビルドしたアプリケーションを、同一サーバ内で2つ運用したいと考えています。
その他、本番・開発用にアプリケーションを分けて開発・運用をする上で、
懸念事項や注意点等があればご教示頂けますと幸いです。

【回答】
開発用フルビルドした後のWagbyappをWagbyインストール箇所以外に配置し、start.batを起動
その後、WagbyDesignerにて本番用の設定に変更しフルビルドし
同様に別途の場所に配置しstart.batを起動とすることで対応できます。
本番用のWagbyDesignerの設定はご認識通り、ポート番号等を変更する必要があります。
また、プロジェクト情報のプロジェクト識別子も変更することをお勧めします。

ライセンスの問題がない場合、開発と本番のサーバは分けることを推奨します。